继别儿怯不花之后，朵儿只为相，他提拔汉人贺惟一为左丞相。这位贺惟一被元顺帝赐以蒙古名字，即“蒙古太平”。以“蒙古”为姓，可见顺帝当时对他的尊宠。
脱脱二次当权，是至元九年夏到至元十四年年底的这一段时间。这几年中，黄河天灾导致“贾鲁治河”，财政危机引致“变更钞法”。天灾人祸，终于使元朝走上不归之路。
脱脱第一次辞相，除身体原因外，也有迷信的原因。“术者言年月不利”，所以，他连上十七道辞职书，方得顺帝允准，下诏封其为“郑王”，并赐金银巨万。而后，别儿怯不花为相，日进谗言。元顺帝把脱脱之父马札儿台外贬，其实也是忆念伯颜跋扈的“旧恶”，恨和尚憎及袈裟，自然慢慢疏远了脱脱。
但是，在脱脱辞相后的几年中，元朝国内叛乱四起，灾害不断，元顺帝等人不得不想起脱脱的“好处”。此外，脱脱自己去甘肃侍候老父，其子加剌张却留在宫中给太子爱猷识理达腊做伴（顺帝正宫皇后生有一子名“真金”，两岁就病死。迷信的元帝室，竟然取与忽必烈太子相同的名字，可见其寿不永）。
这两个孩子同岁，自幼长在一起，脱脱之妻又哺乳过太子，自然关系亲密。两个孩子在皇宫中一起玩，太子让加剌张和自己一同模仿老鸦叫声，张臂作翅膀状，围着大殿奔跑。玩得高兴，太子又让加剌张学老鸦叫，自己要背着他绕殿奔跑。加剌张年纪虽小，却很懂礼数，跪倒说：“我加剌张，不过是奴才身份；太子您是使长，我不敢让您背着我。”
皇太子也是孩童心性，见对方扫自己兴头，抡拳就猛砸加剌张脑袋，砸得小孩子号啕大哭。
元顺帝正在殿内，问左右情由。宦官们便把实情相告。元顺帝连连点头，大喜道：“这孩子真明事理！”
皇后奇氏与脱脱老婆关系不错，也趁机说：“脱脱好人，不应久让他在外。”
顺帝点头。
不久，奸臣哈麻也游说元顺帝让脱脱再入京为相。顺帝很奇怪，问：“脱脱昔日当丞相时，曾抓住你错处，打了你一百零七杖，怎么你也替他说好话。”
哈麻丑表功，说：“脱脱罚我，确实我有过错。为臣如果因此仇视他，就不应该了。脱脱，人还是好人。”
君臣对话间，皇后奇氏正在帘后偷听，她是哈麻真正的“幕后”指使者。见顺帝若有所思，奇氏便派人把脱脱从甘州召回。
哈麻在脱脱初次为相时，与脱脱之弟、御史大夫也先帖木儿关系很铁，日至其门欢饮。所以，每当别儿怯不花中伤脱脱父子兄弟时，哈麻常在顺帝前悉力营护脱脱。彼时，如果哈麻落井下石，估计脱脱当时就可能性命不保。
此外，中书左丞相太平（贺惟一）也是脱脱得还大都的进言人之一。但脱脱对此并不知情。日后，脱脱手下一个小人汝中柏嫉恨太平，唆使脱脱在朝中尽逐太平荐引之人，还差点儿杀掉太平。幸亏脱脱之母解劝，太平在当时才得以不死。
脱脱回京后，并未立即觐见顺帝，因为无诏旨召见他。
一天，乘元顺帝高兴，皇后奇氏忽唤与皇太子玩耍的脱脱儿加喇张，问：“想你爹脱脱吗？”小孩子立即跪倒，说：“我很想爹爹。”顺帝感动，问左右：“脱脱现在何处，可让他回京。”奇皇后忙说：“脱脱已在城中，很想见皇帝您。”
顺帝即刻派人召脱脱入宫。
青年顺帝已懂得玩弄政治手腕。他在棕毛殿端坐，见脱脱入殿跪拜，劈头就问：“我让你在甘州侍父，是谁召你来京？”
顺帝这一问，他身边的奇皇后吓得花容失色。
脱脱很镇静，回答说：“陛下命我侍亲，现服丧已满，故回京见至尊。”
顺帝念忆旧情，也不再装，忙起身降阶，与脱脱相抱而泣。
转天，元廷下诏，再拜脱脱为相。
至正十年（1350年），户部尚书薛世南、武子春揣摩脱脱心意，知道他再入相后想大有作为，便劝他只有大行更张，才能“垂名竹帛于无穷也”。他们两人首先劝脱脱进行钞法“改革”。
改革手段很拙劣，即印制新的中统交钞，以中统交钞一贯文省权铜钱一千文，准至元宝钞二贯。说是新钞，实际是用先前的中统交钞加盖“至正交钞”几个字而已，故而又称“至正中统交钞”。
同时，又铸铜钱，准备以纸币为母，铜钱为子。
元代初期的中统钞，以丝为本；中统元宝钞以及后来的至元钞、至大钞皆以银为本，而现在的新钞本末倒钞，目的只有一个，多印交钞，用纸钱掠夺民间财富。
汉臣吕思诚等人马上提出异议，认为新钞法一行，民间定会把铜钱藏起而弃用纸币。
顺帝、脱脱皆不大懂经济，不听劝阻，下诏大量印钞，最终导致通货膨胀，物价飞涨，新钞变成废纸一样。
如此一来，元朝国内的经济凋敝，先前那钞票通行无阻的神话终于破灭。
自1342年以来，黄河流域灾祸频频，多次泛滥，睢阳、归德一带数为泽国。同时，河北、山西等地又发生几十年不遇的大旱，出现重大饥荒，已有人相食景象出现。1243、1245、1246、1248数年，黄河在曹州、济阴、汴梁等地多次决口，漂毁民房，死人无数。
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