《蓝花》（小说），冰心儿童文学新作奖，1993年11月
《红葫芦》（短篇小说集），《中国时报》1994年度十大童书奖，1995年2月
《红葫芦》（短篇小说集），中国台湾《民生报》《国语日报》《儿童日报》《幼狮少年》等联合主办“好书大家读”年度短篇小说类创作最佳奖，1995年2月
《山羊不吃天堂草》（长篇小说），中国台湾《民生报》《国语日报》《儿童日报》《幼狮少年》等联合主办“好书大家读”年度长篇小说类创作最佳奖，1995年2月
《三角地》（中短篇小说集），中国台湾《民生报》《国语日报》《幼狮少年》等联合主办“好书大家读”年度最佳少年儿童读物奖，1998年2月
《草房子》（长篇小说），中国台湾《民生报》《国语日报》《幼狮少年》等联合主办“好书大家读”年度最佳少年儿童读物奖，1998年2月
《草房子》（长篇小说），第九届冰心文学奖大奖，1998年8月
《草房子》（电影），第八届中国电影童牛奖优秀编剧奖，1999年6月
《草房子》（长篇小说），第四届国家图书奖，1999年10月
《红瓦》（长篇小说），第四届国家图书奖二等奖，1999年10月
《草房子》（电影），第十九届中国电影金鸡奖最佳编剧奖，1999年10月
《草房子》（电影），第十四届德黑兰国际电影节评审团特别大奖“金蝴蝶”奖，2000年
《草房子》（电影），意大利第十三届Giffoni电影节铜狮奖，2000年
《红瓦》（长篇小说），北京市文学艺术奖，2000年
《草房子》（长篇小说），第四届全国优秀儿童文学奖，2000年5月
《草房子》（长篇小说），第五届宋庆龄儿童文学奖小说类金奖，2000年5月
《红瓦房》（长篇小说），中国台湾台北市立图书馆、《民生报》、《国语日报》、《幼狮少年》等联合主办“好书大家读”年度最佳少年儿童读物奖，2001年3月
《红瓦》（长篇小说，韩文版1、2），韩国《中央日报》等评选2001年度“十本好书”，2001年
《二十世纪末中国文学现象研究》（专著），北京大学第八届人文社会科学优秀成果奖一等奖，2002年4月
《根鸟》（长篇小说），第六届宋庆龄儿童文学奖佳作奖，2003年10月
国际儿童读物联盟中国分会（CBBY）中国安徒生奖，2004年2月
国际儿童读物联盟（IBBY）国际安徒生奖提名奖，2004年5月
《细米》（长篇小说），中国作家协会第六届全国儿童文学奖，2004年10月
《细米》（长篇小说），北京市庆祝新中国成立55周年文艺作品征集评奖活动中获荣誉奖，2004年12月
《青铜葵花》（长篇小说），《中国时报》2005年十大好书，2005年12月
《青铜葵花》（长篇小说），中国台湾《民生报》《国语日报》《儿童日报》《幼狮少年》等联合主办“好书大家读”年度长篇小说类创作最佳奖，2006年3月
《青铜葵花》，江苏省精品图书奖，2007年
《草房子》，凤凰传媒集团2006年度畅销书奖，2007年
《稻香渡》（长篇小说），中国台湾台北市立图书馆、《国语日报》、《联合报》、《幼狮少年》等联合主办“好书大家读”年度最佳少年儿童读物奖，2007年4月
《青铜葵花》，第十届中宣部精神文明建设“五个一工程”奖优秀作品奖，2007年9月
《青铜葵花》，中国出版政府奖，2007年10月
《青铜葵花》（长篇小说），中国作家协会第七届优秀儿童文学奖，2007年12月
《黄琉璃》（长篇小说），第二届中华优秀出版物（图书）奖，2008年12月
《我的儿子皮卡》（长篇小说），第三届中华优秀出版物（图书）奖，2010年10月
《黄琉璃》（长篇小说），中国作家协会第八届优秀儿童文学奖，2010年12月
《曹文轩纯美绘本?痴鸡》，第十届（2010年度）输出版优秀图书奖，2011年9月
《丁丁当当?盲羊》（长篇小说），中国作家协会第九届全国优秀儿童文学奖，2013年9月
“丁丁当当”系列（长篇小说），中央电视台科教频道和中国图书评论学会“2013中国好书”，2014年4月
《根鸟》（长篇小说）、《杯子的故事：失踪的婷婷》（绘本），第十三届（2014年度）输出版优秀图书奖，2014年9月
“丁丁当当”系列（长篇小说），博洛尼亚国际童书展以残障儿童为主角的全球最优秀儿童图书奖，2015年4月
《青铜葵花》（长篇小说）、《羽毛》（绘本），第十四届（2015年度）输出版优秀图书奖，2015年12月
国际儿童读物联盟（IBBY）国际安徒生奖，2016年4月
许多朋友都知道，在很多年前我就有写一部幻想类作品的念头，但就在跃跃欲试准备进入写作时，却见此类作品在一些有识之士的张扬与推动下忽然于一天早晨便在中国大地上锣鼓喧天地热闹了起来。它们成了宠儿，成了许多出版社竞相出版的主打作品，一时间，五颜六色，斑斓多彩，纷纷扬扬地飘落在中国人的阅读空间里。加之《哈利?波特》《指环王》《加勒比海盗》等作品与电影之全球性的滚滚热浪对中国的大肆席卷，中国的作家、批评家、出版家以及广大读者终于彻底地认同了一种叫作“幻想文学”的文学，并义无反顾地迷恋上了它。在如此波澜壮阔的情形之下，我想我就没有必要再凑这个热闹了，于是便暂时放弃了这个曾经汹涌在心的念头，依然很平静地去写我的《草房子》《红瓦》《细米》《青铜葵花》式的作品去了。
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